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摘 要
2023年4月份，信得科技检测中心为全国112家猪场提供了检测服务，其中病原学样品700份，血清学样品732份，整体检测量呈上升趋势，主要送检省份仍以山东省为主，河南省送检量有明显提升；4月份PRRSV仍有较高的检出率，PCV3、PEDV和PoRV检出率明显提升。测序结果分析显示PRRSV以NADC30-LIKE基因型为主；PEDV以S-INDEL-LIKE基因型为主；PoRV G5、G9和G3 均有检出。
表1. 中英文缩写
一、 整体检出情况
1. 各省份送检情况
2023年4月份，各地区送检情况统计如下（表2）：
表2. 各省送检量及占比
2. 病原检测数量统计
2023年4月份检测反应总数为1269个，其中阳性反应数量为427个，占比33.7%。病毒检测总数最多的为PRRSV，检出率35.5%；细菌检测总数最多的为HPS和SS，检出率最多的为APP和大肠杆菌；支原体检测总数为45，检出率为84.4%（表3）。
表3. 病原检出数量统计
3. 常见病毒检出统计
2023年4月份病毒检出以PRRSV为主，检出率为25.3%，PPV和JEV送检量较少，结果如下（表4）。
表4. 病毒检出统计
4. 常见细菌和支原体检出统计
2023年4月份细菌检出占比最高的为APP，检出占比为6.3%，HPS和SS检出占比有所下降；支原体检出占比为59.4%（表5）。
表5. 细菌和支原体检出统计
5.2022年与2023年4月份检出率对比
PRRSV同比增长2.7%；PCV2同比增长6.8%；PCV3同比下降11.6%；PEDV同比下降1.0%；PoRV同比增长3.9%；HPS同比下降22.6%；SS同比下降13.5%；巴氏杆菌同比下降18.2%；支原体同比增长23.0%（表6）。
表6. 2022年与2023年4月份检出率对比
二、重点病原检测情况
1. 蓝耳病病毒（PRRSV）
1.1. GP5 基因分析
2023年4月份，检测中心对检测出的PRRSV 进行测序，按照 GP5 编码基因进行基因分型，共测序分型成功26株毒株。其中5株（19.2%）谱系8分支；谱系1有20株（76.9%），其中2株（10.0%）属于NADC34-LIKE分支，18株（90.0%）属于NADC30-LIKE分支；1株（3.9%）属于谱系5分支（图1）。
在谱系8分支中，测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为91.4%~99.3%；在谱系1分支中，测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为82.2%~86.8%；在谱系5分支中，测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为99.1%~99.6%。
图1. 2023年4月份PPRSV GP5基因进化树
1.2 NSP2 基因分析
2023年4月份，检测中心对检测出的PRRSV NSP2 基因进行测序，按照 NSP2 编码基因进行基因分型，共测序分型成功11株独立毒株，其中5株（45.5%）属于谱系8分支，6株（54.5%）均属于NADC30-LIKE分支（图2）。
图2. 2023年4月份PPRSV NSP2基因进化树
2. 流行性腹泻病毒(PEDV)
2023年4月份，检测中心完成4株PEDV Spike蛋白基因（S）测序，根据S1基因进行基因分型，检测出1株G2b基因型毒株（25.0%），3株S-INDEL-LIKE基因型毒株（75.0%）（图3）。
在G2b分支中，测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在97.4%~97.7%；在S-INDEL-LIKE分支中，测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在92.6%~94.0%。
图3. 2023年4月份PEDV S1基因进化树
3.轮状病毒 （PoRV）
2023年4月份，完成5株PoRV VP7（G基因型）基因测序，2株（40.0%）为G5基因型，2株（40.0%）为G9基因型，1株（20.0%）为G3基因型（图4）。
在G5分支中，测序株与疫苗株的核苷酸一致性为72.6%~77.4%；在G9分支中，测序株均与疫苗株的核苷酸一致性为83.0%~86.6%；在G3分支中，测序株与疫苗株的核苷酸一致性为67.4%~68.8%。
图4. 2023年4月份PoRV VP7基因进化树
4. 猪圆环病毒
2023年4月份，根据PCV2 Cap蛋白编码基因进行分型，完成3株PCV2测序，分别属于PCV2a、PCV2b和PCV2d分支。在PCV2a分支中，测序毒株与LG信得疫苗株的核苷酸一致性为95.8%；在PCV2b分支中，测序毒株与DBN-SX07-2信得疫苗株的核苷酸一致性为99.5%；在PCV2d分支中，测序毒株与信得疫苗株的核苷酸一致性为95.3%~97.0%。
2023年4月份，根据PCV3 Cap蛋白编码基因进行分型，完成2株PCV3测序，均属于PCV3a分支；与参考株核苷酸一致性为96.7%~99.2%。
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