摘 要
2023年7月份,信得科技检测中心为全国75家猪场提供了检测服务,其中病原学样品292份,血清学样品582份,合计877份,整体检测量有所下降,主要送检省份仍以山东省为主。7月份PRRSV检测总数较多,在病毒性病原中检出占比为55.1%,较6月份有明显的提高,需要重点关注猪蓝耳病的防控。HPS在细菌性病原中检出占比为39.1%,较6月份有所提升,对HPS等继发性疾病的防控也不容忽视。序列分析结果显示PRRSV以NADC30-LIKE基因型为主。2株测序的PoRV均为G9基因型;PCV2中 2a、2b和2d基因型均有检出,且以2d基因型为主。测序的2株PCV3均为PCV3a基因型。
表1. 中英文缩写
一、 整体检出情况
1. 各省份送检情况
各地区送检场群数见表2。
表2. 各省送检量及占比
2. 病原检测数量及阳性率统计
7月份阳性样品检出率为25.7%,同比增长11.2%。检出率最高的为PoRV(69.2%),同比增长31.7%;PRRSV检出率为36.2%,同比增长16.3%;PCV2检出率为30.2%,同比增长18.5%;HPS检出率为60.0%,同比增长44.1%;支原体的检出率同比下降57.7%,见表3。
表3. 病原检出数量及阳性率统计
3. 阳性样品中病毒占比分析
7月份病毒检出以PRRSV为主,检出占比为63.6%,同比增长30.0%;PoRV同比增长13.3%;PCV2同比下降5.5%,变化幅度不大;PCV3同比下降22.3%,见表4。
表4. 病毒检出占比统计
4. 阳性样品中细菌和支原体占比分析
7月份细菌检出占比最高的是HPS,为39.1%,较去年同期增长12.2%;产气荚膜梭菌和SS同比增长8.7%和6.9%;支原体同比下降14.9%,见表5。
表5. 细菌和支原体检出占比统计
二、重点关注疾病检出
1. PRRSV
1.1 GP5基因分析
2023年7月共计检出PRRSV阳性样品72个,检出率为36.2%,较去年同期增长16.3%,主要分布在山东地区(20个)、辽宁(11个)和山西(10个)(图1)。从病毒混感情况来看,PRRSV与PCV2的混感数量最多,达到8个(图2)。
对19株PRRSV GP5基因序列分析结果表明,15株(79%)为谱系1分支,其中2株(13.3%)属于NADC34-LIKE分支,13株(86.7%)属于NADC30-LIKE 分支;2株(10.5%)属于谱系3分支;2株(10.5%)属于谱系8分支(图3)。主要分布在山东和河南地区,且以NADC30-LIKE基因型毒株为主(图4)。
核苷酸序列一致性分析结果表明,市售疫苗株与谱系1毒株的一致性分别为81.4%~87.4%,与谱系3毒株的一致性分别为81.5%~83.6%,与谱系8毒株的一致性分别为86.4%~96.0%。
图1. PRRSV空间分布及阳性率
图2. PRRSV混合感染情况
图3. PRRSV GP5基因进化树
图4. PRRSV基因型空间分布
1.2 NSP2基因分析
2023年7月份完成12株PRRSV的NSP2基因测序,均属于NADC30-LIKE分支(图5)。
图5. PRRSV NSP2基因进化树
2.PoRV
2023年7月份完成2株PoRV VP7(G基因型)基因测序,均为G9基因型(图6)。G9分支毒株与疫苗株的核苷酸序列一致性在87.9%~88.0%之间。
图6. PoRV VP7基因进化树
3.PCV2
2023年7月共计检出PCV2阳性样品13个,PCV2检出率为30.2%,同比增长18.5%,主要分布在山东地区(5个)(图7)。从病毒混感情况来看,PCV2与PRRSV的混感数最多,达到8个(图8)。
2023年7月份完成8株PCV2 Cap基因测序,4株(50%)为2d基因型,2株(25%)为2b基因型,2株(25%)为2a基因型(图9);主要分布在山东省,2d是主要流行的基因型(图10)。
2a分支毒株与疫苗株LG的核苷酸序列一致性为93.0%~93.4%;2b分支毒株与疫苗株DBN-SX07-2的核苷酸序列一致性为97.9%~99.2%,2d分支与疫苗株的核苷酸序列一致性为90.5%~94.8%。
图7. PCV2空间分布及阳性率
图8. PCV2混合感染情况
图9. PCV2 Cap基因进化树
图10. PCV2基因型空间分布
4.PCV3
2023年7月共计检出PCV3阳性样品8个,PCV3检出率为18.2%,同比减少5.6%。完成2株PCV3 Cap基因测序,均属于PCV3a分支(图12),与参考株核苷酸序列一致性为97.1%~99.2%。
图11. PCV3空间分布及阳性率
图12. PCV3 Cap 基因进化树
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