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鸽业育种迈入全新高效时代！“鸽芯1号”育种芯片研发成功
现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2024/12/17 9:34:10 关注：46 评论： 我要投稿
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江苏省家禽科学研究所特禽学科团队是“鸽芯1号”育种芯片的主导者。该团队以鸽、鹌鹑及特禽（火鸡、珍珠鸡、雉鸡、鹧鸪、鸵鸟和鸸鹋）等品种的发掘评价、创新利用和配套技术的研发为核心，重点开展挖掘鉴定与生产性能高度相关的分子标记、特色禽产品特征品质分析与特征标准研究、肉（蛋）用新品种（配套系）选育，研发绿色、安全、高效养殖新技术和新模式并集成示范应用。先后主持承担国家、部省级以上科研项目20余项。主持培育国家级新品种 “苏威1号肉鸽” 配套系，主持鉴定地方鸽遗传资源“太湖点子鸽”、“豫中鹁鸽”、“黑皂鸽”和“鹤秀鸽”。获得部省、市科技奖7项，授权发明专利13件，主持和参与制定国家（行业）标准6项，在国内外核心刊物上发表研究论文100多篇，出版专著11部。河南天成鸽业有限公司、墨玉县蓝海鸽业发展有限公司和江苏威特凯鸽业有限公司作为团队的主要产学研基地，合作开展多项研究项目，共同致力于推进我国特色禽业新质发展。
近年来，随着人们对高品质、高营养及具有保健功能的禽产品需求的日益增长，鸽肉与鸽蛋凭借其珍稀性逐渐成为了优质高端特色禽产品消费的主流。然而，鸽子的繁殖性能较差，加之其特有的“一夫一妻”繁殖方式和难以实施人工授精的特点，使得鸽育种工作面临着巨大挑战，选育效率难以提升，产业发展也因此受到了严重制约。
为了提高鸽选育效率，节省人力成本，江苏省家禽科学研究所特禽学科团队联合北京康普森农业科技有限公司以石岐鸽为素材，开发了一款鸽繁殖性能50K育种芯片“鸽芯1号”。
这款芯片的诞生，标志着鸽育种工作迈入了一个全新的高效、精准时代。
“鸽芯1号”育种芯片是专为鸽繁殖性能选育而精心打造的液相育种芯片。团队通过生物信息学方法，从海量的遗传信息中精心挑选出与鸽繁殖性能密切相关的功能位点，这些位点如同遗传密码中的“金钥匙”，能够极大地缩短基因分型和全基因组育种周期。同时，该芯片还具有检测成本低，选择准确高等特点。利用“鸽芯1号”育种芯片，可实现快速、精准、高效选育，为鸽选育工作提供强有力的技术支撑和指导依据。
表1 “鸽芯1号”50K育种芯片位点组成及分布数量图片
在研发过程中，团队基于石岐鸽核心群的高深度重测序数据，运用全基因组关联分析（GWAS）技术，成功筛选出了174个与出雏数、出栏数、回蛋时间等繁殖性能相关的功能位点。这些位点集如同育种工作中的“导航仪”，可以直接用于分子标记辅助选择育种，能够更精准地筛选到繁殖性能较优的石岐鸽后代，从而显著加快育种进程，提高育种效率。
除了育种选育，“鸽芯1号”在科研和产业应用方面也展现出了广泛的潜力。它可以应用于鸽选育、全基因组选择育种、全基因组关联分析等多个领域，为育种核心群组建、品种提纯、近交评估、选配方案优化等遗传改良工作提供强有力的工具。此外，该芯片还能够精确鉴定血统渗入及亲缘关系，进行系谱纠偏和亲子鉴定，从而确保鸽品种的纯正性和育种工作的准确性。
在芯片设计方面，“鸽芯1号”采用了国产化设计、检测和分析流程，大大降低了分型成本。同时，该芯片还采用了自动化检测流程，提升了检测通量和稳定性。基于探针杂交靶向捕获测序技术，“鸽芯1号”可以根据需求灵活增加标记位点，升级芯片及扩展应用场景，从而满足育种工作的多样化需求。
值得一提的是，该芯片所选的SNP位点均匀覆盖了鸽子的40条染色体，满足了后续育种工作的需求。通过对所有SNP位点进行基因结构上的分布统计，团队发现MAF最小等位基因频率大于0.1的位点占比高达99.33%，这进一步证明了“鸽芯1号”育种芯片位点选择的合理性和芯片设计的科学性，能够满足大量样本的检测需求。
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| 文章来源：江苏省家禽科学研究所特禽学科团队 文章编辑：一米优讯 |
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